紫外線消毒器（紫外線殺菌器，紫外線消毒儀）的殺菌原理是利用紫外線光子的能量破環(huán)水體中各種病毒、細(xì)菌以及其它致病體的DNA結(jié)構(gòu)。主要是使DNA中的各種結(jié)構(gòu)鍵斷裂或發(fā)生光化學(xué)聚合反應(yīng)，例如使DNA中THYMINE二聚，從而使各種病毒、細(xì)菌以及其它致病體喪失復(fù)制繁殖能力，達(dá)到滅菌的效果。

紫外線殺菌波段主要介于200～300nm之間，其中以253.7nm波長的殺菌能力最強(qiáng)。當(dāng)水或空氣中的各種細(xì)菌病毒經(jīng)過紫外線(253.7nm波長)照射區(qū)域時(shí)，紫外線穿透微生物的細(xì)胞膜和細(xì)胞核，破壞核酸(DNA或RNA)的分子鍵，使其失去復(fù)制能力或失去活性而死亡，從而在不使用任何化學(xué)藥物的情況下殺滅水或空氣中所有的細(xì)菌病毒。