泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng)。
百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺(tái),Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺(tái),Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,推出泛素化定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康母嬖V我們并將您的樣品寄給我們,我們會(huì)負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、泛素化肽段富集、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析。
由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動(dòng)態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對(duì)修飾進(jìn)行富集以提高其豐度,然后利用傳統(tǒng)的定量蛋白組分析手段對(duì)富集得到的泛素化肽段樣品進(jìn)行定量分析。百泰派克公司基于發(fā)表在Nature Protocol上的文章:Large-scale identification of ubiquitination sites by mass spectrometry建立了該分析服務(wù)的實(shí)驗(yàn)平臺(tái),采用完全復(fù)制的方式;首先對(duì)泛素化的蛋白進(jìn)行胰酶消化,在賴(lài)氨酸的修飾位點(diǎn)上會(huì)產(chǎn)生兩個(gè)甘氨酸的殘基(K-GG),利用CST公司提供的針對(duì)該殘基的試劑盒對(duì)泛素化肽段進(jìn)行特異性的富集。我們使用HPLC對(duì)樣品進(jìn)行預(yù)分離,再使用抗特殊殘基結(jié)構(gòu)的抗體進(jìn)行泛素化肽段的富集,極大地提高了泛素化蛋白的鑒定量。同時(shí),在Nature Protocl文章基礎(chǔ)上,為了鑒定和定量更多的乙?;亩?,我們?cè)诿盖羞^(guò)程中會(huì)使用2-3中不同的酶對(duì)蛋白樣品進(jìn)行酶切,保證帶有乙酰化位點(diǎn)的肽段以高離子化效率的方式進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析,排除因?yàn)殡亩伍L(zhǎng)度不合適、離子化效率低造成的乙酰化信息的丟失。
BTP-泛素化定量蛋白組學(xué)研究分析樣品要求
1. 如果您提供的是組織樣品,請(qǐng)您干冰將組織樣品寄給我們;植物組織樣本大于400mg,血液樣品至少2ml(血漿注意用EDTA防凝),血清2ml,尿液10ml,動(dòng)物組織樣品至少2g,細(xì)胞樣品為1X10^8個(gè)細(xì)胞,酵母、微生物等干重400mg。
2. 如果您提供的是蛋白樣品,請(qǐng)您保證蛋白總量在2-5mg;蛋白提取時(shí)使用普通的組織、細(xì)胞裂解液即可。
3. 樣品運(yùn)輸:請(qǐng)使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過(guò)程中樣品降解的可能性。
4. 在正式實(shí)驗(yàn)之前,我們都會(huì)對(duì)您提供的樣品進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)合格后開(kāi)始正式試驗(yàn)。
中/英文項(xiàng)目報(bào)告
在技術(shù)報(bào)告中,百泰派克會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:
1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 鑒定的泛素化位點(diǎn)的詳細(xì)信息
4. 質(zhì)譜圖片
5. 原始數(shù)據(jù)
您只需下單-寄送樣品 百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告