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百泰派克推出SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)
發(fā)布時(shí)間:2020-09-09        瀏覽次數(shù):56        返回列表

SWATH(Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions)由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold團(tuán)隊(duì)與AB SCIEX共同研發(fā)的一項(xiàng)全新的質(zhì)譜**模式技術(shù)。SWATH作為一種DIA (Data Independent Acquisition)技術(shù),將整個(gè)質(zhì)譜掃描質(zhì)量范圍分為若干小窗口,依次對(duì)每個(gè)窗口的所有離子進(jìn)行碎裂,使其能夠?qū)呙鑵^(qū)間內(nèi)的所有肽段離子進(jìn)行高速一級(jí)MS掃描再進(jìn)行二級(jí)MS/MS分析。因此,SWATH能夠?qū)?fù)雜樣品中幾乎所有可檢測(cè)的分子進(jìn)行定量測(cè)定。SWATH綜合了shotgun proteomics高通量檢測(cè)的特點(diǎn)與**定量分析的優(yōu)勢(shì),是真正意義上的全景質(zhì)譜檢測(cè)手段MS/MS ALL。 百泰派克公司采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨質(zhì)譜系統(tǒng),具有快速掃描速度和串聯(lián)四極桿質(zhì)譜系統(tǒng)的定量靈敏度能力,集質(zhì)譜系統(tǒng)的高分辨、準(zhǔn)確質(zhì)量數(shù)穩(wěn)定性、高靈敏度和高速度掃描特點(diǎn)于一身,推出SWATH定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的樣品寄給我們,我們會(huì)負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析。

 

SWATH技術(shù)特點(diǎn)

? 定量鑒定復(fù)雜的樣品中所有分子,包括低豐度蛋白和肽段

? 定量準(zhǔn)確度高:定量準(zhǔn)確度與MRM技術(shù)相當(dāng)

? 通量大:一次實(shí)驗(yàn)可定量檢測(cè)到2000種以上蛋白

? 完整**信息存儲(chǔ),能夠存儲(chǔ)MS,MS/MS每個(gè)峰值的數(shù)據(jù),同一樣本無需進(jìn)行重復(fù)檢測(cè)

? 無需像MRM技術(shù)需要提前調(diào)試樣品測(cè)定方法

 

SWATH/DIA的優(yōu)勢(shì)介紹

對(duì)于復(fù)雜樣品定量分析主要的問題往往來自于樣品本身高豐度蛋白的干擾,從而難以鑒定到低豐度蛋白。許多DDA(Data Dependent Acquisition)質(zhì)譜鑒定方法,都是在MS級(jí)別鑒定肽段,優(yōu)先篩選MS信號(hào)強(qiáng)的肽段進(jìn)行二級(jí)碎裂,因此低豐度的肽段不易被選擇進(jìn)行二級(jí)分析。而SWATH/DIA則是對(duì)樣品中的所有分子無差別地進(jìn)行分析,并一次性將所有肽段的MS,MS/MS數(shù)據(jù)進(jìn)行儲(chǔ)存,以保證不遺漏任何可能重要的數(shù)據(jù)??偟膩碚f,SWATH極大地提高了定量分析的可信度,并能夠**測(cè)定復(fù)雜樣品中豐度極低的蛋白分子。

 

另外,相比MRM需要根據(jù)待檢測(cè)的目標(biāo)分子進(jìn)行檢測(cè)方法優(yōu)化,SWATH無偏差分析所有分子,不需要提前對(duì)檢測(cè)方法進(jìn)行優(yōu)化,只需要在已獲得檢測(cè)數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上對(duì)分析方法進(jìn)行優(yōu)化即可。因此,SWATH分析能夠?yàn)槟鷺O大得縮短檢測(cè)分析的周期。

 

生物信息學(xué)分析

? SWATH譜圖分析,蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估

? 多組分樣本PCA分析

? 鑒定的蛋白功能注釋:GO功能注釋、 KEGG功能注釋和COG功能注釋

? 差異表達(dá)蛋白統(tǒng)計(jì)分析:韋恩圖、火山圖(Volcano Plot)

? 差異表達(dá)蛋白聚類分析:層次聚類、K-means聚類

? 差異蛋白相互作用分析:基于STRING 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

 

中/英文項(xiàng)目報(bào)告

在**終的技術(shù)報(bào)告中,百泰會(huì)為您提供詳細(xì)的中英文雙語(yǔ)版技術(shù)報(bào)告,報(bào)告包括:

 

1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)

2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)

3. 質(zhì)譜圖片

4. 原始數(shù)據(jù)

5. 蛋白差異水平分析

6. 生物信息學(xué)分析

 

您只需下單-寄送樣品,百泰派克一站式服務(wù)完成:樣品處理-上機(jī)分析-數(shù)據(jù)分析-項(xiàng)目報(bào)告




 
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